Museum yang berada di tepi Kali Gajah Wong ini menyimpan berbagai macam lukisan karya Affandi. Selain itu, benda peninggalan Affandi lainnya seperti mobil, sepeda onthel dan sebagainya juga tersimpan di museum ini. Menempati lahan seluas 3.500 meter persegi, bangunan museum ini dilengkapi dengan 4 galeri, dua studio, dan bangunan tempat tinggal pelukis Affandi dan keluarga.

Jarak Museum Affandi dari tempat ini adalah sejauh 25,7 km melalui Jalan Kaliurang dan dapat ditempuh dalam waktu kurang lebih 54 menit.